Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdkn2cQ60772 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdkn2cQ60772 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cdkn2cQ60772 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms