Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf3Q60765 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atf3Q60765 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atf3Q60765 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 845.8 ms