Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ItgaeQ60677 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ItgaeQ60677 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ItgaeQ60677 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms