Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sik1Q60670 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sik1Q60670 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sik1Q60670 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms