Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Sin3aQ60520 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sin3aQ60520 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sin3aQ60520 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms