Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A1cfQ5YD48 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A1cfQ5YD48 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A1cfQ5YD48 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms