Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmtk3Q5XJV6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmtk3Q5XJV6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmtk3Q5XJV6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms