Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp20Q5XG71 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Utp20Q5XG71 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Utp20Q5XG71 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms