Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd5Q5VCS6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Tdrd5Q5VCS6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd5Q5VCS6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms