Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mks1Q5SW45 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Mks1Q5SW45 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mks1Q5SW45 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms