Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmn1r196Q5SVD5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r196Q5SVD5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms