Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam71bQ5STT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fam71bQ5STT6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam71bQ5STT6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms