Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI5

Brsk1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk1Q5RJI5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brsk1Q5RJI5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brsk1Q5RJI5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brsk1Q5RJI5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brsk1Q5RJI5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms