Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trdv2-2Q5R1A4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdv2-2Q5R1A4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms