Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rtp3Q5QGU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rtp3Q5QGU6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rtp3Q5QGU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms