Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
Trim41Q5NCC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Trim41Q5NCC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Trim41Q5NCC3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Trim41Q5NCC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Trim41Q5NCC3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms