Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1810065E05RikQ5NC41 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
1810065E05RikQ5NC41 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1810065E05RikQ5NC41 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms