Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Xaf1Q5NBU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Xaf1Q5NBU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms