Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8P2

Gm5169, Predicted gene 5169, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5169Q5M8P2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5169Q5M8P2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5169Q5M8P2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5169Q5M8P2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms