Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps41Q5KU39 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps41Q5KU39 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms