Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrrc8bQ5DU41 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc8bQ5DU41 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms