Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Usp13Q5BKP2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp13Q5BKP2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms