Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Xirp2Q4U4S6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xirp2Q4U4S6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xirp2Q4U4S6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xirp2Q4U4S6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xirp2Q4U4S6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xirp2Q4U4S6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 790.8 ms