Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3aQ4TU90 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rhox3aQ4TU90 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rhox3aQ4TU90 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms