Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Khdc1cQ4KL78 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Khdc1cQ4KL78 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Khdc1cQ4KL78 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms