Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Shank3Q4ACU6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Shank3Q4ACU6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms