Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5935Q497S0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5935Q497S0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5935Q497S0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms