Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2al1nQ497L1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al1nQ497L1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms