Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmub2Q3V209 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmub2Q3V209 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmub2Q3V209 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms