Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rimbp3Q3V0F0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rimbp3Q3V0F0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms