Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp48Q3V0C5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp48Q3V0C5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp48Q3V0C5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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