Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933427I04RikQ3V053 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4933427I04RikQ3V053 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933427I04RikQ3V053 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms