Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc55Q3UY51 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc55Q3UY51 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc55Q3UY51 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms