Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn13Q3UW68 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn13Q3UW68 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Capn13Q3UW68 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms