Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr1d1Q3UV55 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr1d1Q3UV55 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms