Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Prom2Q3UUY6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prom2Q3UUY6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prom2Q3UUY6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms