Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B230104I21RikQ3USW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B230104I21RikQ3USW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B230104I21RikQ3USW4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms