Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhdc9Q3USL1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhdc9Q3USL1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms