Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms