Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fcho2Q3UQN2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fcho2Q3UQN2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fcho2Q3UQN2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms