Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfp953Q3UPV7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp953Q3UPV7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp953Q3UPV7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms