Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cln5Q3UMW8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cln5Q3UMW8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cln5Q3UMW8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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