Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cobll1Q3UMF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cobll1Q3UMF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms