Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Greb1Q3UHK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Greb1Q3UHK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms