Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zswim8Q3UHH1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zswim8Q3UHH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zswim8Q3UHH1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms