Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trafd1Q3UDK1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trafd1Q3UDK1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms