Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem109Q3UBX0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem109Q3UBX0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem109Q3UBX0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem109Q3UBX0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms