Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf180Q3U827 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf180Q3U827 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf180Q3U827 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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