Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gtpbp6Q3U6U5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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