Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3U6N9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3U6N9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3U6N9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3U6N9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3U6N9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q3U6N9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q3U6N9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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