Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hvcn1Q3U2S8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hvcn1Q3U2S8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hvcn1Q3U2S8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms